Analisador de ácidos nucleicos LabChip GX Touch

O sistema LabChip GX Touch oferece as seguintes funcionalidades:

²Tecnologia de microfluidos LabChip para análise moderna de eletróforese em gel

²Análise totalmente automática de amostras genômicas em tempo real, a análise de amostras de detecção pode ser tão rápida quanto30 segundos.

²Formatos de dados digitais para análise, visualização, compartilhamento e arquivamento

²Indicadores quantificadores de integridade de amostras de RNA e DNA para garantir que somente as melhores amostras possam entrar no processo downstream

²Fluxo máximo de processamento Uma plataforma eficiente para 24 amostras economiza tempo e dosagem de reagentes;

Fluxo máximo de processamento 384 modelos para fluxos de trabalho de alto fluxo

Se o seu laboratório de sequenciamento precisa analisar amostras escassas e valiosas, ou Com processos livres de PCR ou que requerem quantificação de cada fragmento de amostra para análise de genotipagem, o analisador de ácidos nucleicos LabChip GX Touch, fácil de usar, de baixo custo, de alto rendimento e flexível, pode reduzir significativamente a carga de analisar um número crescente de amostras.

A tela táctil LabChip GX Touch simplifica a análise de amostras:

1. Operação Touch

²Carregar placas de amostra e chips

²Selecionar a amostra (até uma vez) 384 amostras

²Escolha o tipo de experimento

²Contato"Execute" e comece o experimento.

²Você pode até permitir que o sistema exporte automaticamente os dados diretamente para a sua rede

²Rede ou Sistema LIMS (Figura 2)

imagem2. A análise de dados começa com uma interface de tela táctil fácil de usar

2. executar Observação em tempo real

²Análise de amostras leva menos tempo 30 segundos.

²O pico de eletroferese é visível em tempo real durante a coleta de dados

²Comparação do espectro de sobreposição de dados coletados no ambiente de execução

²Selecionar diferentes anotações de características de análise de tempo de execução

3. Revisão Ver dados em tempo real ou exportar para análise futura

²Selecione a exibição como gráfico de pico de eletroforese, gráfico de gel virtual ou folha de dados 3）

²usar TIBCO Spotfire ® Software de visualização de dados melhora os resultados analíticos

²Recolha dados de amostras de placas múltiplas selecionadas para análise paralela

²Selecionar dados para filtrar aplicativos com atributos críticos

²Destacar o pico de alvo

imagem3. Opções flexíveis de dados permitem visualização ou exportação em tempo real em muitos formatos

O software LabChip GX Touch permite experimentar com uma pequena quantidade de configurações. O arquivo de parâmetros de configuração experimental pode ser baixado para o instrumento e executado ao tocar um botão. Os parâmetros experimentais que mantêm automaticamente os parâmetros da última execução experimental continuam a executar vários lotes de amostras.

Módulos de software para facilitar a visualização dos mesmos dados ajudam os cientistas a ver amostras concluídas longe do trabalho do laboratório. As licenças de uso do software são ilimitadas e os dados podem ser compartilhados entre colegas, tornando a colaboração no projeto simples e direta.

Os arquivos de dados do LabChip GX Touch são compatíveis com o TIBCO Spotfire (opcional).

Enviar somente amostras de ácido nucleico de alta qualidade para o downstream

A análise eletroforesa é um componente importante do controle de qualidade da biblioteca de sequência de segunda geração, fornecendo ao mesmo tempo o tamanho do fragmento de cada amostra e informações quantitativas.O LabChip GX Touch automatiza a análise de tamanho e concentração de fragmentos de DNA e RNA e amostras de esmeio para o controle de qualidade de amostras de biblioteca sequenciadas. A análise de amostras fragmentadas é geralmente usada para testar cruzadamente o efeito das etapas de fragmentação ou PCR. A análise total de DNA das amostras da biblioteca é uma etapa de uniformização.

Economia de amostras

Reduzir o consumo de amostras durante a análise é um fator importante que muitos laboratórios consideram. Para sequenciamento de co-precipitação imunológica cromossómica e É essencial preparar amostras de biblioteca em concentrações muito baixas por métodos como PCR-free. O kit NGS 3K foi desenvolvido especialmente para esses processos de sequência com requisitos particularmente elevados de sensibilidade. O LabChip pode suportar concentrações de até 2,5 pg/μL

de A quantificação precisa é feita com esmeios e fragmentos de 0,2 pg/μL, permitindo uma análise rápida de amostras escassas e valiosas (Figura 4).

imagemA imagem acima mostra a sensibilidade das amostras de DNA NGS 3K. As mesmas amostras da biblioteca NGS foram diluídas em série de três vezes seis vezes e os resultados experimentais mostraram o limite inferior da concentração da amostra de detecção do LabChipDNA NGS 3K. Os resultados são apresentados no instrumento LabChip GXTouch.

Análise rápida RNA

A plataforma LabChip Touch fornece concentrações de RNA fáceis de entender e proporções de RNA ribosomal, que são usadas em conjunto com pontuações de qualidade de RNA como indicadores de avaliação de integridade (Figura 5). A pontuação de qualidade do RNA (RQS) é uma avaliação quantitativa da qualidade e integridade de uma amostra que prevê a probabilidade de sucesso de experimentos de expressão genética downstream, como análise de chip ou PCR em tempo real.

Exceto Além dos valores RQS, o software de análise agora pode calcular automaticamente os valores DV200. Ambos os valores podem ser exportados e usados ​​para determinar a qualidade de amostras de RNA de amostras como FFPE. Certificado, RQS e Agilent^® também ( RNA

Índice de Integridade) está intimamente relacionado e segue o mesmo Classificação quantitativa 0-10.

Genoma Pontuação de degradação de amostras de DNA

para Os experimentos de DNA genômico desenvolvidos pelo sistema LabChip GX Touch introduziram a pontuação de qualidade do DNA genômico (GQS) como alternativa à eletroferese em gel tradicional. Os dados eletrônicos fornecidos são compatíveis com sistemas de gerenciamento de informações de laboratório e podem ser facilmente arquivados e distribuídos. Análise rápida de amostras de DNA de 25 a 12.000 bp em 30 a 60 segundos (até 40.000 bp para testes de integridade de gDNA) (Figura 6)。

imagem5. RNADiagrama de eletróforese, que mostra18Se28So pico

imagem6. Genomas mostrados em um mapa de eletróforeseAvaliação da qualidade do DNA

Análise de pequeno RNA

O kit de pequeno RNA LabChip é capaz de isolar e medir rapidamente uma variedade de amostras de pequeno RNA entre 20 e 150 nucleoglicéridos (nt), incluindo miRNA, siRNA, piRNA, tRNA e CRISPR-gRNA. Este novo método de análise de pequenos fragmentos de RNA permite analisar rapidamente e automaticamente o tamanho e a abundância relativa de pequenos fragmentos de RNA, economizando tempo e custos.

A tecnologia de eletróforese capilar microfluida LabChip é capaz de separar e analisar automaticamente pequenas amostras de RNA em um minuto. O software do sistema analisa automaticamente os dados para determinar o tamanho e a concentração de fragmentos de pequenas amostras de RNA usando referências e padrões internos (Figura 7).

imagem7.O LabChippequenoRNAMétodo de detecção pode medir automaticamente pequenasRNAtamanho do fragmento da amostra, Tem alta precisão e precisão.

eletroferese Labchip

Princípio de funcionamento

O LabChipA eletroferese é realizada em pequenos chips de microfluido (Figura)8）。 Carregar o chipLabChip GX ToqueApós o sistema, o buraco do chip entra em contato com o eletrodo de platina, que fornece o controle de tensão e corrente. O braço robótico do sistema move o furo da amostra na placa microporosa diretamente para o capilar do chip "suctor" abaixo, aproximadamente150 nLAs amostras são aspiradas para o chip. As amostras a serem analisadas são separadas por eletroferese, e a faixa de amostra é detectada por fluorescência induzida por laser. AtravésescadaDetermine o tamanho e a concentração de cada faixa.

imagem 8.Princípio de funcionamento da eletroferese Labchip

LabChip GX Toque Especificações do Reagente

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