Promethion 2 Integrado

I. Visão geral do produto

Promethion 2 Integrado(P2i) é um pequeno dispositivo de mesa projetado para executar até duas unidades de velocidade PromethION. Cada unidade móvel é endereçável independentemente, o que significa que os experimentos podem ser realizados simultaneamente ou separadamente. O P2i é um produto independente que inclui computação de nível empresarial e é responsável por toda a coleta de dados e chamadas de endereços base no dispositivo. Ele também permite que os usuários forneçam serviços de sequenciamento de nanoporos.

Promethion 2 IntegradoInclui duas portas de sequência para inserir unidades de fluxo. O dispositivo possui as mesmas funcionalidades do menor PromethION 2 Solo, mas com recursos de computação adicionados * e uma GPU NVIDIA Ampere incorporada que permite chamadas de base de dados em tempo real de duas unidades de streaming PromethION. Os produtos químicos e software atuais suportam a geração de até 290 Gbases* de dados a partir de uma única unidade de fluxo PromethION (* saída teórica Max baseada em sequência de 420 bases/s por 72 horas).

II. Tecnologia básica

O sequenciamento Oxford Nanopore baseia-se na tecnologia de detecção monomolecular de nanoporos. Durante a sequência, as moléculas de ácidos nucleicos (DNA/RNA) são movidas por motorases, em uma única cadeia, base por base, através dos nanoporos. Quando a base passa, a intensidade da corrente dentro do nanoporo é alterada e há diferenças no sinal de corrente correspondente às diferentes bases (A, T, C, G) e à base modificadora. Os dispositivos capturam essas mudanças de corrente em tempo real através do MinKNOW ™ O software é convertido em uma sequência de bases para realizar a sequência direta de moléculas individuais. A tecnologia não requer amplificação de PCR e mantém informações de modificação de base com um comprimento de leitura ilimitado, permitindo análise de dados em tempo real de forma portátil e eficiente.

Vantagens principais de desempenho

Design de desktop integrado com alta integração:A forma de equipamento de desktop totalmente auto-incluído, com módulos de computação integrados completos, sem computadores ou servidores externos adicionais, simplifica significativamente o processo de implantação do equipamento, economiza espaço de laboratório e se adapta a uma variedade de cenários científicos e clínicos.

Poder de cálculo + controle intuitivo, eficiência:GPU de alto desempenho para suporte computacional suficiente para tarefas de análise complexas, como reconhecimento de bases em tempo real e montagem de genomas; Equipado com uma tela incorporada, você pode ver diretamente informações críticas como o progresso da sequência, sinais de corrente e outros, facilitando a interação operacional.

Duas células de fluxo paralelas e flexíveis para adaptação:Com suporte para até duas células de fluxo PromethION em execução simultânea, a sequência independente de canal único ou a inicialização sincronizada de canal duplo podem ser selecionadas de acordo com as necessidades experimentais, tanto para a detecção rápida de amostras em lotes pequenos quanto para tarefas de sequência de fluxo médio e alto, com maior flexibilidade no uso de recursos.

Plug-and-play pré-configurado com limiar muito baixo:A pré-configuração do sistema é concluída na fábrica, sem a necessidade de depuração de parâmetros complexos, conectando a fonte de alimentação para iniciar o processo de sequência, mesmo os técnicos não profissionais podem começar rapidamente, reduzindo significativamente os custos de operação e manutenção.

Suporte de armazenamento e computação de alto desempenho:Equipado com um SSD de 16 TB para armazenar localmente grandes quantidades de dados de sequência sem depender de dispositivos de armazenamento externos; A RAM de alta largura de banda de 64 GB garante um fluxo fluido de leitura, escrita e análise de dados, com GPUs da Série A da NVIDIA* que oferecem potência computacional poderosa para reconhecimento de bases complexos em tempo real, montagem genômica e análise de variações, reduzindo significativamente o tempo de análise de dados.

Interação HD e adaptação flexível:Equipado com tela táctil de alta resolução, pode mostrar claramente o progresso de sequência, sinais de corrente, resultados de análise de dados e outras informações-chave, a interação operacional é mais intuitiva e precisa; Ao mesmo tempo, suporta o acoplamento à infraestrutura de computador existente, facilitando a operação através de uma tela táctil local ou integrando-se a sistemas originais do laboratório, adaptando-se flexibilmente a diferentes hábitos de uso e fluxos de trabalho.

Área de aplicação

Estudo de todo o genomaDados 8Tb de canal único podem alcançar sequenciamento profundo de 30 vezes mais do genoma humano completo, leitura longa auxilia a montagem completa do genoma T2T (telômero a telômero), analisando variações estruturais complexas;

Análise Profunda do MacrogenomaO alto rendimento suporta a sequenciamento profundo do macrogenoma de amostras ambientais complexas como o solo e os oceanos, para detectar micróbios de baixa abundância (< 0,1%) e anotar com precisão os genes funcionais;

Ensaios clínicos em massaDuais canais podem processar centenas de amostras clínicas simultaneamente (por exemplo, sequenciamento de todo o genoma do vírus), e a análise de dados em tempo real facilita a classificação rápida e o monitoramento de variações para apoiar a resposta a emergências de saúde pública;

Pesquisa de reprodução de plantas e animaisFornecer dados de leitura longa de alto fluxo para grandes genomas de plantas e animais (por exemplo, trigo e genomas bovinos), auxiliando o desenvolvimento de marcadores moleculares e a construção de mapas genéticos.

Especificações do equipamento

*Gama funcional de dispositivos eletrônicos +5ºC a +40ºC

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