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Zebrafish (Beijing) Technology Co., Ltd
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Sequenciador de nanoporos de terceira geração PromethION 24

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Visão geral

O sequenciador de três gerações de nanoporos PromethION 24 oferece uma solução de sequenciamento de mesa flexível e de alta capacidade, ideal para grandes projetos e laboratórios de alto fluxo. Destes, o PromethION 24 suporta até 24 unidades de fluxo, com uma saída de dados máxima de até 14T bases. Cada unidade móvel funciona de forma independente e oferece serviços de sequência de leitura de comprimento sob demanda de acordo com as necessidades experimentais. Os módulos de cálculo de alto desempenho integrados ao dispositivo permitem o reconhecimento de bases em tempo real e análises de seguimento para obter resultados de sequência rapidamente.

Detalhes do produto

I. Visão geral do produto

Sequenciador de nanoporos de terceira geração PromethION 24É um dispositivo de alto rendimento com a mesma tecnologia básica que os dispositivos MinION e GridION, mas com processamento em paralelo em grande escala. Esta série de equipamentos suporta até 24 experimentos de sequenciamento simultaneamente, cada um independentemente. Além disso, os usuários podem fornecer serviços de sequenciamento de nanoporos com o dispositivo PromethION.
Sequenciador de nanoporos de terceira geração PromethION 24Composto por unidades de sequência e unidades de coleta de dados da série A: a unidade de sequência possui 24 portas de sequência para inserção em unidades de fluxo PromethION; As unidades de coleta de dados são equipadas com computadores integrados de alto desempenho e aceleradores de reconhecimento de bases. O dispositivo identifica em tempo real os dados gerados por 24 unidades de fluxo. Com o suporte atual de reagentes químicos e software, uma única unidade de fluxo PromethION pode produzir até 200 Gbases de dados.


II. Tecnologia básica


O sequenciamento Oxford Nanopore baseia-se na tecnologia de detecção monomolecular de nanoporos. Durante a sequência, as moléculas de ácidos nucleicos (DNA/RNA) são movidas por motorases, em uma única cadeia, base por base, através dos nanoporos. Quando a base passa, a intensidade da corrente dentro do nanoporo é alterada e há diferenças no sinal de corrente correspondente às diferentes bases (A, T, C, G) e à base modificadora. Os dispositivos capturam essas mudanças de corrente em tempo real através do MinKNOW ™ O software é convertido em uma sequência de bases para realizar a sequência direta de moléculas individuais. A tecnologia não requer amplificação de PCR e mantém informações de modificação de base com um comprimento de leitura ilimitado, permitindo análise de dados em tempo real de forma portátil e eficiente.

纳米孔三代测序仪PromethION 24


Vantagens principais de desempenho


Sequência flexível sob demanda, sem a necessidade de esperar por lotes de amostras:O tempo e o conteúdo da sequência podem ser selecionados independentemente de acordo com as necessidades, e as unidades de fluxo suportam operações individuais ou conjuntas sem demora para o volume de amostra; A capacidade de sequência de uma única unidade de fluxo é cerca de seis vezes maior do que a unidade de fluxo MinION, atendendo às necessidades de dados de diferentes tamanhos.

Paralelo multitarefa de alto fluxo para laboratórios de serviço:Suportando a realização simultânea de vários experimentos de DNA ou RNA, a combinação de tecnologia de código de barras aumenta ainda mais o processamento de amostras, responde de forma eficiente a cenários de sequência de alto fluxo e oferece aos usuários serviços de sequência de nanoporos profissionais.

Limite de implantação baixo para todos os tipos de laboratórios:O equipamento ocupa uma área pequena e pode ser instalado sem a necessidade de transformar as instalações de laboratório existentes; Simplifique o processo de implantação com suporte técnico completo, que pode ser facilmente adaptado para pequenos laboratórios de pesquisa ou grandes organizações de serviços.

Computação integrada de alto desempenho para análise eficiente e fácil:Sequência e análise combinadas com CPU de nova geração, GPU NVIDIA Série A de 4 blocos, armazenamento SSD de 60 TB e 512 GB de RAM; O sistema operacional Ubuntu e o software MinKNOW são pré-instalados para iniciar a sequência e a análise em tempo real, reduzindo drasticamente o ciclo de obtenção de resultados.


Área de aplicação


Sequenciamento de grandes genomas ou projetosAdaptar-se a conjuntos complexos de genomas humanos, grandes plantas e animais (como arroz, gado) ou grandes projetos de pesquisa coerentes em várias fases. Suas 24 unidades móveis funcionam sincronizadamente, unidades móveis únicasSaída de dadosMax 200Gb, Capacidade superior ao do MinION6 vezesCapaz de cobrir rapidamente sequências repetitivas de grandes genomas e áreas de variação estrutural, combinado com análise em tempo real de força computacional para reduzir o ciclo do projeto.

Estudo de sequenciamento de tamanho de grupoAplicável para análise de associação de doenças humanas, triagem de populações de reprodução animal e vegetal e outros cenários. O suporte à sequência paralela de múltiplas amostras, a tecnologia de códigos de barras para processamento eficiente de centenas de amostras populacionais, 512 GB de RAM e 4 GPUs da série A da NVIDIA garantem comparações rápidas de dados em grande escala e detecção de variações, proporcionando soluções de alto fluxo para pesquisas em genética populacional.

Sequenciamento de pequenos genomas ou regiões alvo multiplex altoDetecção em lote de pequenos genomas, como bactérias, fungos, ou análise regional direcionada a genes que conduzem o câncer humano e alvos de medicamentos. As 24 unidades móveis podem ser divididas para processar diferentes grupos de amostras, e a alta capacidade de uma única unidade satisfaz as necessidades de cobertura profunda da área alvo, sem a necessidade de esperar por lotes de amostras, adaptando-se a tarefas de sequência de massa pequena de alta frequência, como testes clínicos e construção de bibliotecas de recursos microbianos.

Estudo do transcritoma completo (RNA direto ou cDNA)Suporta a análise de corte variável do transcrito completo de plantas e animais, monitoramento dinâmico da transcrição microbiana. O sequenciamento direto de RNA mantém a informação de modificação da base e o sequenciamento de cDNA cobre transcrições de baixa abundância; A capacidade de cálculo integrada do dispositivo pode analisar sequências de transcrições de comprimento completo em tempo real, evitar erros de junção de leitura curta e longa, e ajudar na regulação da expressão genética e na triagem de transcrições relacionadas com doenças.


Especificações do equipamento


Tamanho e peso Unidade de sequência Promethion 24:
Altura 190 x Largura 590 x Profundidade 430 mm, 23 kg
Especificações da unidade de coleta de dados 60TB de armazenamento SSD, 512GB de memória, 4 cartões GPU NVIDIA Ampere para aceleração de chamadas básicas
Software pré-instalado Linux (Ubuntu) como sistema, Promethion como sistema(Internamente MinKNOW),Software Dorado
Condições ambientais Projetado para a sequência em temperatura ambiente (+18°C a +22°C),
O usuário deve reservar um espaço de 30 cm na parte traseira e lateral do dispositivo.
Atenção:A parte traseira do instrumento aquece durante a operação.





Peixe Zebra (Pequim) Tecnologia Co., Ltd, fornecer-lhe os parâmetros do instrumento, preço, seleção, princípios técnicos e outras informações, para obter mais informações, entre em contato conosco.