48 erros relacionados ao dispositivo de síntese genético:

1. Erro do sistema de amostragem

Flutuação da precisão da pipeta:

As bombas ou válvulas de pipeta em diferentes canais podem variar, resultando em quantidades de amostragem inconsistentes (por exemplo, distribuição desigual de monómeros de base).

Após uso prolongado, as peças de pipeta se desgastam ou bloqueiam, causando desvios de volume.

Poluição cruzada:

Uma selabilidade insuficiente entre os canais resulta na difusão de resíduos líquidos ou voláteis, causando contaminação por bases ou enzimas.

2. Erro de controle de temperatura

Diferença de temperatura do sistema de reação:

A homogeneidade de temperatura do módulo de aquecimento de 48 canais é insuficiente e algumas temperaturas de orifício são altas ou baixas, afetando a eficiência da extensão.

A taxa de aquecimento/arrefecimento é inconsistente, o que resulta em uma resposta de PCR ou conexão não sincronizada.

Desigualdade de pressão da tampa térmica:

A tampa térmica não está em contacto com a placa de reação, e alguns orifícios evaporam gravemente, alterando o volume do sistema de reação.

Detecção de erros do sistema

Desviés de detecção de fluorescência/absorção:

A diferença de sensibilidade do detector óptico em diferentes canais resulta em erros de avaliação da eficiência da síntese.

A interferência de ruído de fundo (como extinção ou dispersão de fluorescência) afeta a precisão do monitoramento em tempo real.

4. Falha mecânica

Separação de esferas magnéticas ou mistura oscilante desigual:

A diferença de intensidade do campo magnético do módulo magnético resulta em uma eficiência diferente de recuperação de esferas magnéticas, afetando o efeito de lavagem ou purificação.

A frequência ou o tempo de oscilação são inconsistentes, resultando em uma mistura inadequada da reação.

Operação e erros de processo de 48 sintetizadores genéticos:

1. Erro de configuração do programa

Desvio de entrada de parâmetros:

Os ciclos de síntese (por exemplo, tempo de extensão, temperatura de deformação) são configurados incorretamente, o que resulta em maior comprimento do segmento ou taxa de repartição errada.

Os parâmetros não são ajustados de acordo com o tipo de modelo, como GC alto, estrutura secundária.

Vulnerabilidades de scripts de automação:

Procedimentos de múltiplas etapas (como corte, ligação, purificação) são mal ligados, resultando em interrupção da reação ou tratamento excessivo.

2. Problemas de carregamento da amostra

Ordem de amostragem ou posição errada:

A amostragem artificial não foi operada de acordo com as especificações (por exemplo, sem substituir a cabeça de arma), introduzindo contaminação de DNA estranho.

Diferenças na quantidade de material inicial em diferentes canais (por exemplo, concentrações diferentes de precursor) resultam em eficiências de síntese desiguais.

Purificação e reciclagem de baixa eficiência

Perda de purificação de esferas magnéticas ou de silicone:

Pequenos fragmentos de DNA (como oligonucleótidos curtos) são absorvidos durante o processo de purificação, reduzindo o rendimento.

Lavagem inadequada*, sal ou impurezas residuais inibem a reação posterior.