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instrumentb2bBiologia Sintética (IV) Pesquisador Josh: redesenhar a síntese química da medicina chinesa com o "Lego de produtos naturais"

Preface




O caminho de pesquisa do pesquisador Josh é inseparável da “Medicina do Norte” – desde que entrou em 2003, continuou a ensinar em 2012 e formou um grupo de temas após retornar de uma visita no exterior em 2018, nunca foi longe há mais de duas décadas. Ela zombou de si mesma como uma pesquisadora "muito terrena":No crescimento e desenvolvimento da medicina da Universidade do Norte, a medicina chinesa tradicional é objeto de pesquisa, e a direção da pesquisa sempre gira em torno de um núcleo: os produtos naturais da medicina chinesa.

合成生物学研究先锋侧记(四) 乔雪研究员

Mas “terra” não significa conservação. O estudo a longo prazo do sistema complexo da medicina chinesa lhe fez perceber as limitações dos métodos tradicionais de pesquisa. Quando os experimentos farmacológicos exigem moléculas candidatas de grau gramático, e as substâncias são extremamente baixas, os métodos tradicionais de extração e separação enfrentam grandes desafios. Esse gargalo levou-a a se voltar para a biologia sintética.Não depender de medicamentos, mas "cultivar" os ingredientes eficazes da medicina chinesa com os micróbios.

O caminho não foi fácil, mas ela encontrou uma nova linguagem para contar a história da medicina chinesa.

Da "medicina analítica" à "medicina sintética":

Caminho de transformação impulsionado por gargalos científicos

O ponto de partida da pesquisa de Josh é a análise da composição química da medicina chinesa. Devido à complexidade da composição da medicina chinesa, o grupo de especialistas tem dependido de longa data da cromatografia líquida (LC) e da combinação cromatografia líquida-espectroscopia de massa (LC/MS) para sua análise. Mas a análise só pode ser “vista”, não “obtida”. O problema surge quando estudos farmacológicos ou clínicos exigem quantidades suficientes de compostos. Só a combinação líquida não pode obter o composto alvo, mesmo que tenha uma fase líquida de preparação de grande escala, também está limitada ao conteúdo natural dos ingredientes alvo na medicina, consumirá uma grande quantidade de recursos e recursos humanos e materiais da medicina chinesa.

Foi esse dilema de “ver, mas não conseguir” que a levou a se voltar para a pesquisa de biosíntese em 2015. Desta forma, o grupo de temas passou de "medicina analítica chinesa" para "medicina sintética chinesa", concentrando-se gradualmente no mecanismo de biosíntese dos produtos naturais das plantas e entrando formalmente no campo da biologia sintética.

"Lego de produtos naturais": novas possibilidades trazidas pela diversidade das enzimas

Ao explorar como as plantas sintetizam moléculas ativas, os pesquisadores Josh apresentaram uma metáfora da imagem - "Lego de produtos naturais".

Essa ideia vem de uma nova compreensão da função enzimática. Os livros de ensino do ensino médio enfatizam a "singularidade das enzimas, uma chave abre uma fechadura", mas estudos práticos descobriram que muitas enzimas têm "promiscuidade" - a capacidade de catalisar diferentes combinações de substratos com flexibilidade. Por exemplo, uma enzima pode ligar A a B, A a C e até mesmo continuar a ligar D em base a AB. "A natureza dá uma grande criatividade às proteínas. disse Josh.

Existem muitos “blocos de construção” gerais na natureza, como a glicose, o ácido canélico, a coenzima acetil A, etc. Essas pequenas moléculas são amplamente distribuídas e podem ser montadas flexibilmente como "blocos" por enzimas em produtos naturais diversificados. O nome "LEGO" deriva dessa característica modular e combinavel. Essa propriedade abre a possibilidade de construir "produtos naturais não naturais" - preservando esqueletos naturais e introduzindo modificações não naturais para explorar atividades farmacológicas melhores.

Aterramento e desafios: do lótus dourado à proteção dos recursos da medicina chinesa

Atualmente, o grupo aplicou essa ideia à síntese de vários ingredientes ativos da medicina chinesa. Um exemplo representativo é o lótus dourado, uma medicina chinesa selvagem cujo clima e tempo de colheita afetarão seus ingredientes ativos.Carboninas flavonosasO conteúdo.

A equipe de Yi Min / Joshe da Faculdade de Farmácia da Taitai passou muito tempo analisando a via de biosíntese da flavonocarbonosida e, em colaboração com a equipe do professor Cai Menghao da Universidade Politécnica Oriental da China, importou toda a via para a levedura, alcançando uma fermentação de alto rendimento de 20 g / l. "Isso significa que o futuro não dependerá dos recursos selvagens e terá acesso estável a ingredientes essenciais."

合成生物学研究先锋侧记(四) 乔雪研究员

O pesquisador Josh aponta que esses resultados podem ser usados ​​para pesquisa e desenvolvimento de medicamentos naturais, por um lado, e, por outro lado, são importantes para a proteção dos recursos da medicina chinesa: quase metade da medicina chinesa comumente usada na China depende da colheita selvagem, se for possível produzir ingredientes-chave através da fermentação, reduzirá significativamente o consumo de recursos selvagens. Além disso, enzimas e fatores reguladores encontrados em estudos de biosíntese também podem ser usados ​​na criação molecular para ajudar a selecionar plantas medicinais de alta qualidade.

Iluminar as biosintesas dos ingredientes da medicina chinesa é tecnicamente desafiador. "Muitos genomas vegetais são maiores do que os humanos, e a identificação de genes alvo é como uma agulha de pesca no mar." A equipe de Josh é excelente na estratégia de "análise de correlação": reduzir o escopo de candidatos, perturbando as plantas e observando mudanças sincronizadas nos compostos alvo, intermediários e expressão genética. Essa estratégia depende fortemente de técnicas de teste analítico preciso.Na escolha do instrumento, o grupo de especialistas escolheu a cromatografia líquida e a combinação líquida, e o conhecimento de muitos dos ingredientes comuns da medicina chinesa foi feito com base nos instrumentos LC/Q-TOF e 2D-LC/MS da Agilent.

Pesquisa é algo divertido que todos fazem juntos.

O pesquisador Josh admite que o seu trabalho científico não foi uma decisão deliberada, mas uma escolha razoável. Isso é devido ao pedido do professor - o professor Godan, o professor Yemen, no campo da medicina chinesa, a profunda acumulação e o espírito de apego a influenciaram profundamente. “Pesquisa é uma coisa interessante, escolher fazer é fazer bem.” Ao educar seus alunos, ela sempre se esforçou para criar um ambiente de pesquisa livre e aberto, incentivando-os a sair da zona de conforto e manter a curiosidade por novas coisas e novas tecnologias. Durante o processo experimental, a inteligência, a diligência e a perseverança dos alunos são importantes para o avanço contínuo do tema.

合成生物学研究先锋侧记(四) 乔雪研究员

A pesquisa de Josh também é inesquecível sem o valioso apoio de colaboradores, colegas e especialistas técnicos da Agilent, cujas opiniões construtivas em várias trocas foram uma inspiração importante para o avanço do tema.

“Medicina Sintética Multicomponente” para o Futuro


Os pesquisadores Josh esperam que a IA desempenhe um papel maior na extração genética e no design enzimático, impulsionando a inovação do paradigma de pesquisa em biologia sintética de plantas. No futuro, talvez seja possível produzir uma "medicina sintética multi-componente" consistente com os ingredientes da medicina chinesa através da fermentação bacteriana de engenharia, protegendo a medicina chinesa das limitações do clima, da terra e do ciclo de colheita, fornecendo uma nova solução para o uso sustentável dos recursos.

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