Sistema de seleção de embalagem de molção de fragmentos de DNA

O Xdrop é um instrumento versátil e fácil de usar para preparar células, órgãos celulares, DNA ou outros materiais biológicos vivos de mamíferos ou micróbios para análises downstream de alta resolução.

Usar o nossoO Xdrop encapsula com segurança e rapidez fragmentos de células vivas, órgãos celulares ou DNA, juntamente com a substância química de teste, em gotas de dupla emulsão de volume de litro altamente estável. Essas gotas são estáveis ​​por pipeta, vortex, incubação, citologia de fluxo, seleção e até mesmo armazenamento a longo prazo. Mais importante ainda, as células podem ser recuperadas de gotas para amplificação.

Com as técnicas de análise adequadas,Os aplicativos Xdrop incluem:

• células imunológicas humanas,Células NK

• Secreção enzimática de células microbianas

• Células de mamíferos secretam citoquinas

• Validar a edição de genes, incluindo a avaliação de reorganizações inesperadas no alvo e fora do alvo

com ajudaXdrop， Os pesquisadores podem obter uma visão mais profunda da função celular e da genômica em seres humanos, animais, plantas e micróbios. O Xdrop também pode gerar gotas de emulsão única para outros fluxos de trabalho, incluindo encapsulamento de DNA para amplificação genômica inteira sem desvios. Oferecemos o conjunto completo de reagentes, kits e acessórios necessários para o Xdrop. Além disso, o treinamento do usuário faz parte do nosso serviço de instalação padrão do Xdrop.

Vantagens

• O Xdrop envolve células vivas de mamíferos ou micróbios em gotas de emulsão dupla altamente estáveis para determinação funcional, incubação, análise fenotípica e triagem.

• Xdrop ajuda a responder a perguntas-chave na pesquisa de engenharia celular e terapia genética.

• O Xdrop suporta fluxos de trabalho de engenharia molecular, incluindo evolução enzimática e engenharia de vias.

• O Xdrop tem uma interface fácil de usar e uma área pequena que permite que todos os laboratórios de biologia molecular utilizem as funções de microfluidos*.

Kit de emulsão de duas camadas

Todos os reagentes estão incluídos em caixas que podem encapsular milhões de células ou moléculas por operação.

Exemplos de aplicação:

1、Ampliação precisa de todo o genoma

Na verdade,99% do genoma alvo foi coberto mais de uma vez por leituras de sequenciamento em bibliotecas.

usarXdrop ™ A tecnologia dMDA amplifica todos os genes com fidelidade e precisão, mesmo quando a entrada é tão baixa quanto 1 pg.

2 – Estabelecimento genéticoFaseamento

O allelo CYP2D6*7 contém polimorfismo de um único nucleótido（SNP）， O CYP2D6*25A contém 22 SNPs.

A tecnologia Xdrop é capaz de medir com precisão todas as 23 variantes, incluindo Phasing.abaixoimagem).

Xdrop ™ Suporta a aplicação com um design simples e captura de sequências indiretas de fragmentos longos de DNA (~100 kb). Combinado com sequência de leitura longa, Xdrop ™ A dificuldade de fazificação genética em amostras genéticamente heterogêneas individuais foi superada.

A alta fidelidade enriquecida permite detectar um ou mais allelosSNP， E permite a montagem a partir do zero para resolver mudanças estruturais.

Monitoramento de mudanças estruturais complexas em genes

Uma análise detalhada das leituras que atravessam os pontos de parada mostra queExistem vários locais de integração do HPV18 na região do cromossomo 8. Os conjuntos de dados PacBio, Oxford Nanopore e Illumina suportam os locais de integração identificados.

Xdrop ® A tecnologia é um novo método de enriquecimento de DNA direcionado, o que é desejável é que fragmentos naturais de DNA podem ser selecionados, enriquecidos e sequenciados. Isso permite enriquecer grandes partes do genoma (cerca de 100 kb), incluindo áreas desconhecidas. Usando Xdrop ® Os fragmentos longos gerados pelo método não são apenas adequados para sequências de leitura longa, mas também fornecem informações contextuais valiosas para sequências de leitura curta.

Áreas de interesse desconhecidas (Sequência do ROI

PCR e métodos de enriquecimento de DNA direcionado baseados em sondas exigem otimização intensiva do projeto eÁrea de interesse completa (ROI) Conhecimento. Estes métodos tradicionais caracterizam a complexidadeambiente genômico (por exemplo, regiões duplicadas, variações estruturais, riquezaRegião do GCdomínio), bem como os aspectos regionais desconhecidos e reorganizados também falharam. Para superar essas restrições,A Samplix desenvolveu um novo método de microfluidos baseado na captura de sequências indiretasConseguido.Xdrop ® enriquecer o fluxo de trabalho.

Xdrop ® Pode enriquecer o comprimento necessário para projetar pares de primeiros individuais em sequências de detecção（~100 kb) área de DNA alvo, correspondente a uma pequena parte do ROI ou área lateral. Este amplificador é projetado para detectar, selecionar e enriquecer o ROI de todo o comprimento para captura e sequência.

usarXdrop ® A capacidade da tecnologia para resolver essas áreas desafiadoras abre as portas para resolver muitas outras áreas desafiadoras, que podem representar um grande percentual da base.devido ao grupo. SeráXdrop ® O enriquecimento, combinado com a tecnologia de sequência de leitura longa e curta, fornece a alta resolução necessária para resolver cenários genômicos complexos de forma rápida e econômica, evitando o sequência de todo o genoma.

5 Identificação e confirmaçãoOperações de edição de genes CRISPR

Através de um design simples e longoCapturando sequências indiretas de fragmentos de DNA, o Xdrop ajuda a identificar locais de inserção geneticamente modificados que geralmente são difíceis de encontrar e caros.

A integração aleatória no corpo construído e a presença de sequências do genoma do hospedeiro complicam a localização integrada.O Xdrop torna a engenharia genômica de validação simples.