LuzEmpresa lançadoO MiSeq é um novo sequenciador que integra amplificação, sequência e análise de dados em um único instrumento e pode gerar mais de 1Gb de dados por execução em apenas 2 pés quadrados. O processo e a precisão do MiSeq tornam-no a plataforma ideal para análises genéticas rápidas e econômicas para uma ampla gama de aplicações. Enquanto o Illumina foi adquirido em massa pela FDA e está prestes a ser certificado pela FDA, em outubro de 2012, o fluxo de sequência do sistema MiSeq foi atualizado para cerca de 8G. A atualização é feita em dois aspectos, um é o aumento da densidade do cluster, a densidade do cluster aumentará para 15-17 milhões após a atualização, e o número de leituras do par-end aumentará para 30-34 milhões; Por outro lado, o fluxo foi aumentado pelo comprimento da leitura de sequência, o comprimento da leitura de sequência atingiu 2 * 300bp, ao mesmo tempo que a velocidade de sequência também foi melhorada. Atualmente, o Instituto Broad já usou os reagentes existentes para alcançar o sequenciamento de uma extremidade de 300 bp de comprimento de leitura, e o sequenciamento interno da Illumina atualmente concluiu o sequenciamento de par-end de 2 * 400 bp. Tudo isso é feito com base em dados de alta qualidade.

Parâmetros de desempenho do MiSeq

Tempo de sequência Illumina MiSeq e quantidade de dados

Comparação de leitura Illumina MiSeq

Fluxo de trabalho

Sequenciador de segunda geração illuminaMiSeq quatroGrandes características

Ciclo experimental mais curto: leva 8 horas a partir do início da preparação da amostra para obter resultados de sequência de alta qualidade de mais de 100M.

Processo de preparação de amostras conveniente: é necessário um modelo de 50ngDNA, e 2 horas de operação automatizada podem completar todo o trabalho de preparação de amostras.

Princípio de sequenciamento: o MiSeq continua o princípio químico de sequenciamento de laterais sintéticos das plataformas GA e HiSeq.

Integração completa: o MiSeq pode realizar a geração de clusters, o sequenciamento bidirecional e a análise de dados de forma independente, para que o financiamento e o espaço de laboratório não sejam mais obstáculos para a pesquisa do NGS.

Sequenciador de segunda geração illuminaAplicações do MiSeq

1 Sequência de transcrição

A Plataforma de Sequenciamento MiSeq da Passenor é uma plataforma de análise transcriptiva de espécies sequenciadas pelo genoma. A equipe técnica da empresa já concluiu a sequência e análise do transcritoma de várias plantas e animais, incluindo peixes zebras.

Sequenciamento da região V única do rDNA 16S do macrogenoma

Sequenciamento de alto fluxo da única região V (V3 V4) do ADNr 16s para identificar a flora bacteriana e paleontológica. A equipe técnica da Passenor identificou com sucesso as bactérias do ambiente intestinal das galinhas usando o Illumina MiSeq para sequenciar a região V4 do 16S rDNA e em combinação com o Roche 454 FLX+ para sequenciar as regiões V1 a V3 do 16S rDNA.

Sequência de pequeno RNA

O comprimento de leitura de 1 * 35bp é combinado com o comprimento de sequência de pequeno RNA, velocidade rápida e alta sensibilidade. A equipe técnica da Paisennor já concluiu o sequenciamento de pequenos RNAs em gansos e em várias ervas.

Re-sequenciamento: inclui o sequenciamento completo do genoma, sequenciamento simplificado do genoma e sequenciamento de exons.

O Illumina MiSeq é ideal para a reesequenciação de genomas microbianos, permitindo que um genoma microbiano seja sequenciado a cada execução. Em 27 de dezembro de 2011, a equipe técnica da Paisennor reutilizou o MiSeq para sequenciar simultaneamente bactérias lácticas (Lactobacillus casei Zhang e Lactobacillus casei P8) com uma profundidade de cobertura genômica de 404 e 213 vezes, respectivamente, em comparação com a sequência de referência, alcançando a cobertura total do genoma, detectando várias variações estruturais, incluindo inserção, ausência e locais SNP, e detectando todos os plasmídeos.

Apresentação de dados

* As descrições dos produtos e dados acima são da Illumina, apenas para fins informativos.De acordo.