Experimento de co-precipitação imunológica

Interações entre DNA e proteínas ligadas ao RNA: CHIRP

Experimento de co-precipitação imunológicaIsolamento de cromatina por purificação de RNA (CHIRP) é um método para detectar as interações de DNA e proteínas ligadas ao RNA no corpo, analisando simultaneamente as interações de IncRNAcircRNA, proteínas e DNA.

Significado do experimento CHIRP

O IncRNA pode interagir com proteínas, DNA e RNA para diversificar suas funções, e o CHIRP pode explorar o DNA com o qual o IncRNA interage. O estudo do IncRNA desempenha um papel importante nas atividades da vida, como a regulação epigenética, e o CHIRP é um estudo

O IncRNA é uma técnica importante para identificar a interação do RNA com a cromatina em todo o genoma e analisá-la qualitativamente, quantitativamente e localizativamente.

Princípio do experimento CHIRP

O CHIRP (Isolamento de Cromatina por Purificação de RNA) é uma sonda de ácido nucleico ligada à biotina que puxa o RNA alvo para baixo e os fragmentos cromossómicos de DNA que interagem com ele (complexo de DNA e proteína) são adsorvidos e, posteriormente, podem ser detectados por qRT-PCR.

Processo experimental do CHIRP

① Projeto de sonda: Projeto de sonda de nucleótido de uso contrário:

culturas celulares;

Células quebradas:

A sonda de DNA marcada por biotina é híbrida com o RNA;

⑤ CHIRP;

Extração de proteínas de ligação de RNA, DNA e ácidos nucleicos; .

Análise de teste. ,

Mostrar resultados

Ciclo de conclusão e critérios de entrega

1. Ciclo experimental: 1-3 meses

Critérios de entrega: relatório de resultados de identificação CHIRP, relatório de análise, relatório experimental (reagentes, consumíveis, etapas experimentais), dados brutos, etc.

Informações que o experimento precisa confirmar com o cliente

Informações genéticas e proteínas de destino.

Tipo de amostra e gênero

3) Necessidade de análise

Referências

[1]lyer S, Modali S D, Agarwal S K. O longo ARN não codificador MEG3 é um determinante epigenético da sinalização oncogênica em células tumorais neuroendócrinas pancreáticas funcionais [J]. Biologia Molecular e Celular, 2017: MCB.00278-17.

[2] Chu C, Chang H Y. Compreendendo as Interações RNA-Cromatina Usando Isolamento de Cromatina por Purificação de RNA (ChIRP). [J]. Métodos em Biologia Molecular, 2016, 1480.

[3] ZhuJJ, FuHJ, Wu Y G, et al. Função de IncRNAs e abordagens para interações de proteína IncRNA [J]. Ciência

Ciências da Vida da China, 2013, 56(10):876-885.

Serviço em parte experimental