Padrões de prestação de serviços de detecção personalizados para chips de RNA anel

Serviços de detecção personalizada de chips de RNA circular

Introdução técnica experimental: RNA Anular(ircRNA) é um novo tipo de RNA que se distingue do RNA linear tradicional, com uma estrutura de anel fechado e abundante no eunucleio transcrito. A maioria do RNA anel é composta por sequências de exons, conservadoras em diferentes espécies, com especificidade de expressão em diferentes estágios de desenvolvimento e tecidos. PorqueRNA AnularNão é sensível à nucleosase e, portanto, é mais estável do que o RNA linear, o que dá ao RNA anel uma vantagem significativa em aplicações de desenvolvimento como um novo marcador diagnóstico. Estudos recentes mostraram que o RNA anel desempenha o papel de esponja de miRNA em diferentes espécies, chamado de RNA endógeno competitivo (ceRNA), que se liga competitivamente ao miRNA. A interação com o miRNA associado à doença sugere que o RNA circular desempenha um papel muito importante na regulação da doença.

Processo de operação experimental:

Extração de amostras de RNA

Teste de qualidade do RNA

Usando Nanodrop para medir a absorção de RNA em espectrofotômetros de 260nm, 280nm e 230nm para calcular a concentração e avaliar a pureza.

② com o reagente de eletroferese formaldeído para eletroferese em gel de gonadotase degenerado, para detectar a pureza e integridade do RNA.

Fornecer um relatório de QC de RNA.

Processamento RNase R

Síntese e marcação de amostras de cDNA/aRNA

Eficiência de marcação de teste de qualidade Usando Nanodrop para detectar a eficiência da marcação fluorescente, a eficiência da marcação é qualificada para garantir a confiabilidade dos resultados da experiência do chip posterior.

6. híbrido de chips

Sondas marcadas e chips genômicos de alta densidade são híbridos em condições padrão.

Captura de imagens e análise de dados

Utilize o scanner lunar de núcleo GenePix 4000B para digitalizar a intensidade de fluorescência do chip e converter os resultados experimentais em dados digitais para serem salvos, usando o software de acompanhamento para analisar os dados brutos.

8) Fornecer relatórios experimentais

①Scanning Image: imagem de varredura de fluorescência Cy3;

②Scatter Plot: gráfico de dispersão, o eixo X é o valor do sinal de controle, o eixo Y é o valor do sinal de experimento, representando a tendência geral de distribuição de dados de sinal;

②Raw Data: dados brutos sobre a intensidade do sinal fluorescente da sonda;

Dados normalizados: valores normalizados após métodos estatísticos;

Valor P: O teste T analisa estatisticamente a diferença significativa na expressão de genes, e quanto menor o valor p, mais significativa a diferença na expressão de circRNA entre os dois grupos de amostras.

Lista de circRNAs regulados significativamente para cima e para baixo: A lista de circRNAs com diferenças significativas de expressão contém informações detalhadas sobre a mudança de dobra, o valor p e as notas do circRNA (os locais de ligação de mRNA e miRNA lineares correspondentes).

Os clientes oferecem:

1, o objeto do experimento é uma amostra de tecido, tomar a quantidade apropriada (50-100mg) de amostra de tecido fresco ou amostra de tecido corretamente conservada, usar

O BioPulverizer TM congela o tecido triturado, adicionando 1 m de reagente de extração de RNA TRIzol (Invitrogen), após a extração de RNA usando a homologação Mini-Bead-Beater-16.

2, o objeto experimental é uma amostra de células, cada amostra toma 1x106 ~ 1x107 células, adicionando 1 m de reagente de extração de RNA TRIzol (amostra de células de parede adesiva, a quantidade de uso de TRIzo1 por placa de 10 cm2 é de 1 ml), após a fissão do RNA extraído.

Padrões de entrega:

1. dados de detecção de chip

Procedimentos completos de operação experimental, relatórios experimentais (incluindo resultados de análise de software) e materiais experimentais

Experimento em serviço: