Espectroscopia de massa pode ser usada para sequenciamento de proteínas?

Espectroscopia de massa pode ser usada para sequenciamento de proteínas?Detalhes do serviço técnico de inspeção

I. Introdução de antecedentes

A sequência do dànbáizhì revela diretamente a sequência de aminoácidos do dànbáizhì, que é a base para a compreensão da estrutura e função do dànbáizhì. O sequenciamento da proteína permite prever ainda mais a estrutura tridimensional do dànbáizhí e, em seguida, analisar suas funções biológicas e mecanismos de interação. Isso é importante para revelar os mistérios das atividades da vida e entender a ocorrência e o desenvolvimento de doenças. As técnicas atuais de sequenciamento de proteínas são principalmente: sequenciamento de espectro de massa a partir do zero, degradação de Edman, sequenciamento de nanoporos. Atualmente, a aplicação mais comum é a sequência do zero com base no espectro de massa dànbáizhì. O sequenciamento de proteínas de novo é uma nova técnica de sequenciamento que não depende de qualquer sequência conhecida ou informação de banco de dados de dànbáizhì para determinar diretamente a sequência de aminoácidos de dànbáizhì, especialmente para identificar proteínas totalmente novas. Os anticorpos, como moléculas de bìbùkěshǎo no nosso sistema imunológico, são ferramentas valiosas no campo do diagnóstico e tratamento médico, e a sequência de dànbáizhì do zero tem aplicações importantes no campo dos anticorpos.

II. Processo técnico

A sequência de dànbáizhì baseada em espectroscopia de massa é a utilização de um espectrômetro de massa para coletar informações de qualidade sobre a sequência de aminoácidos de segmentos peptídicos, ou seja, um espectrograma secundário, analisando a sequência de segmentos peptídicos diretamente do espectrograma de massa secundário por meio de um algoritmo de sequência do início, e depois de fazer o splicing da sequência, obtém a sequência completa de aminoácidos de dànbáizhì. O processo técnico da sequência de zhìpǔfǎdànbáizhì é o seguinte: preparação de amostras → enzimólise de dànbáizhì → separação de segmentos peptídicos → espectroscopia de massa → análise de dados. As questões a serem observadas na sequência de zhìpǔfǎdànbáizhì são: ① durante a preparação da amostra, tente evitar a degradação de dànbáizhì; ② Escolha a enzima adequada para a enzimólise de dànbáizhì; Garantir a estabilidade do desempenho do espectrômetro de massa e melhorar a precisão dos dados.

III. Estudos

A globulinose C monoclonal (MGUS) é uma doença plasmocitária caracterizada pela presença de um anticorpo monoclonal principal (a proteína M) no soro. Os autores detectaram a proteína M IgG1 no soro humano por meio de análise associada de cromatografia líquida-espectroscopia de massa. O corte enzimático da proteína M foi realizado usando várias proteases, analisando o segmento peptídico de anticorpos usando o método de sequenciamento do zero, e após a junção do segmento peptídico, zuí finalmente determinou a sequência da cadeia pesada e leve da proteína M completa. Além disso, os autores caracterizaram os níveis de glicosilação na região CDR dos anticorpos.

A sequência do espectro de massa dànbáizhì ajuda a descobrir novos alvos de drogas, fornecendo informações críticas para o projeto e a triagem de drogas. Através da técnica de sequenciamento, os cientistas podem identificar dànbáizhì associados à doença e, em seguida, projetar medicamentos para esses dànbáizhì para implementar o tratamento jīngzhǔn. Com a tecnologia de sequência dànbáizhì, os médicos podem avaliar o estado da doença do paciente com mais agilidade, prever a evolução da doença e, assim, desenvolver programas de tratamento mais personalizados. Isso não só melhora o efeito do tratamento, mas também reduz os efeitos colaterais e melhora a qualidade de vida do paciente.

Baseada na literatura publicada na Nature Biotechnology e na revista de proteômica JPR de zhuānyè, a empresa desenvolveu um software de análise de sequências de anticorpos com base no conhecimento histórico existente de zhuānyè, com métodos de cálculo de dados em bruto do espectro de massa auto-desenvolvidos, usando o princípio de abrangência e restrição, para alcançar a identificação precisa de sequências de anticorpos / proteínas sem perder nenhuma informação de dados eficazes. Os espectrômetros de massa Orbitrap Eclipse e Orbitrap Fusion Lumos de alta resolução e sensibilidade atual são usados durante o processo de sequência para garantir a qualidade dos dados e a precisão dos resultados. O ciclo do projeto de sequenciamento de proteínas/anticorpos é de 3 a 4 semanas.

IV. Citações Literárias

[1] Albert, Denboer, Arjand, et al. Detecção direta baseada em espectrometria de massa e sequenciamento de anticorpos de gamopatia monoclonal de importância indeterminada do soro do paciente: um estudo de caso [J]. Journal of Proteoma Research, 2023, 22(9):3022-3028.

Bandeira N, Pham V, Pevzner P, et al. Automated de novo protein sequencing of monoclonal anticorps [J]. Natureza Biotecnologia, 2008, 26(12):1336-1338

Projetos de Biotecnologia da Betypake

Sequência de proteínas

Usando o novo espectrômetro de massa Obitrap Fusion Lumos da Thermo e o sistema de sequência de degradação Edman da Shimazu para analisar sequências de dànbáizhì, a Biotechnolojia da PT fornece serviços de análise de sequência de proteínas baseadas em espectro de massa, incluindo análise de composição de aminoácidos de dànbáizhì, análise de Nduāncèxù, Cduāncèxù e sequência completa, bem como análise de sequências do extremo N de dànbáizhì baseada em degradação Edman. Para a dànbáizhì com sequências teóricas desconhecidas, oferece-se um serviço de sequenciamento a partir do zero baseado no método de sequenciamento a partir do zero para a análise da sequência da proteína.

* Vantagens do serviço:

Adota o Obitrap Fusion Lumos, o instrumento de espectroscopia de massa mais avançado do mundo;

Cobertura de 100% da sequência de proteína alvo determinada;

Determinação de até 70 sequências de aminoácidos na extremidade N da proteína;

As amostras podem ser determinadas em várias formas: solução de proteína, faixa de proteína PVDF;

Baixa dose de amostra: a amostra de proteína só precisa de 5-10ug para completar o teste;

A sequência não é afetada por modificações da extremidade N, como fechamento da extremidade N, PEC e glicosilação.

II. Organização de dànbáizhì

A Plataforma de Espectroscopia de Massa Orbitrap Fusion Lumos da Thermo Fisher combinada com a Nano-LC oferece uma variedade de serviços de análise de dànbáizhì, incluindo dànbáizhì quantitativa, dànbáizhì direcionada, polipéptida e proteômica modificada após tradução. Além disso, a PT Biotech lançou um novo serviço de dànbáizhì 4D baseado no timsTOF Pro, que facilita pesquisas em proteômica de amostras em microescala, medicina de grandes amostras e modificação de alta potência.

* Vantagens do serviço:

1 . Análise quantitativa de proteínas de alto fluxo: análise experimental em larga escala em grupos de controle múltiplos para a descoberta de novos biomarcadores;

2. vários métodos de marcação de dànbáizhì in vivo e in vitro, aplicáveis ​​à análise de tecidos, células, sangue e outras amostras;

Alta sensibilidade à análise espectrôlica de massa e alta repetição dos resultados experimentais;

4. pode detectar proteínas de baixa abundância, ampla gama linear;

5.zhuānyè análise bioinformática, análise mais sistemática e precisa.

Análise técnica de fluxo de espectro de massa de célula única

A biotecnologia da Betypake utiliza o sistema de fluxo de espectroscopia de massa Fluidigm para a análise técnica de fluxo de espectroscopia de massa de célula única, marcando a superfície da célula e as moléculas internas com marcadores de elementos metálicos (geralmente anticorpos específicos marcados com elementos metálicos), em seguida, separando as células individuais com o princípio da célula de fluxo, analisando o espectro de massa atômico de células individuais com espectroscopia de massa de plasma acoplado por indução (ICP-MS), e depois convertendo os dados do espectro de massa atômico em expressão molecular de sinal na superfície da célula e no interior.

* Vantagens do serviço:

Tecnologia avançada para preencher lacunas tecnológicas

A tecnologia de anticorpos marcados por metais evita os problemas de que os canais de fluorescência de fluxo tradicionais são poucos e fáceis de interagir. Com a capacidade de caracterizar vários indicadores simultaneamente a nível de uma única célula, a biotecnologia da Peptide pode detectar simultaneamente 51 proteínas alvo.

Grande quantidade de análise e baixo custo

O RNAseq de célula única é limitado por fatores como o custo, o número de células agregadas de todas as amostras é geralmente de cerca de 2x10 ^ 4, enquanto a tecnologia de espectroscopia de massa de fluxo pode analisar pelo menos 10 ^ 5 células de uma só vez (amostra única), alcançando um aumento quantitativo e o custo não é maior do que o RNAseq de célula única.

Grandes perspectivas de aplicação

Os resultados da espectroscopia de massa de fluxo podem dar mudanças na subpopulação celular, com grandes perspectivas de pesquisa no diagnóstico clínico e no estudo do mecanismo da doença;

Combinar a tecnologia de etiquetagem metálica com outras tecnologias terá uma nova direção de aplicação. Além das proteínas convencionais, a tecnologia celular de fluxo de massa também pode ser usada para modificação pós-tradução de proteínas;

É possível detectar a taxa de sobrevivência celular, tamanho celular, expressão de transcritor de mRNA, taxa de síntese de DNA e atividade de protease.

Análise imunopoliptídeomica com base em espectro de massa de alta precisão e descoberta de novos antígenos

A solução única para análise imunopoliptídeomica baseada em espectroscopia de massa de alta precisão e descoberta de novos antígenos da Biotec inclui nossa solução patenteada e altamente sensível de enriquecimento e identificação de imunópeptidos. Podemos ajudá-lo a identificar e identificar mais de 10.000 polipéptidos tipo I e mais de 10.000 polipéptidos tipo II. A análise imunopeptidómica é realizada através da nossa plataforma de análise imunopoliptídeomica de alto fluxo otimizada para identificação e quantificação repetida a partir de materiais de amostras pequenas do zuì. O serviço pode ser aplicado a pesquisas em larga escala para ajudar os pesquisadores a encontrar soluções para câncer, doenças imunológicas e doenças infecciosas e explorar alvos desconhecidos.

V. Caracterização Biofarmacêutica

Baseado em tecnologia de espectroscopia de massa de alta resolução, MALDI TOF， Tecnologia de separação cromatográfica de alta eficiência que oferece uma gama de soluções de análise de biofarmacêuticos de wánshàn, desde a composição de aminoácidos e análise estrutural de nível 1 de produtos biológicos como dànbáizhì, péptidos, anticorpos e vacinas até a análise de variabilidade e pureza do produto. O objetivo é fornecer serviços de análise de biomedicamentos de alta qualidade para ajudar os fabricantes de biomedicamentos a melhorar a qualidade dos biomedicamentos.

As sete principais plataformas de teste da biotecnologia

BioTecnologia da PTP - Caracterização de produtos biológicos, prestador de serviços de alta qualidade de espectrometria de biomassa

A Beijing Baitepike Biotechnology Co., Ltd. é dedicada a fornecer serviços de zhuānyè como testes de controle de qualidade e validação de projetos para as indústrias de dispositivos biológicos / farmacêuticos e médicos. Os laboratórios da empresa seguem as regulamentações e os princípios orientadores da NMPA, ICH, FDA e EMA, passaram pela certificação do sistema de qualidade duplo CNAS / ISO9001, estabeleceram um sistema de qualidade completo, backup de dados a frio e a calor / fora do local, medição regular do equipamento / verificação durante, rastreamento de auditoria de software, fornecendo soluções integradas e serviços técnicos para os clientes, apoiando o desenvolvimento de novos medicamentos, registro de declaração de medicamentos e lançamento de produção.

A empresa adota o sistema de controle de qualidade ISO9001, zhuānyè fornece serviços de análise de teste CRO baseados em espectro de massa;

Reconhecido pelo laboratório nacional CNAS para fornecer aos clientes serviços de pesquisa de qualidade de medicamentos em conformidade com as regulamentações farmacêuticas globais;

3. O âmbito de atividade abrange a dànbáizhí ómica, polipéptida ómica, metabólica, caracterização biofarmacêutica, análise de célula única, fluxo de espectro de massa de célula única, análise de nuvem de vida e análise de integração de espectro de matéria de vários grupos de estudantes, etc.

Sete plataformas de teste de controle de qualidade para atender às suas necessidades de serviço de parada única;

Serviço 3000 + empresas, escolha de 10000 + clientes;

Dedicado a fornecer-lhe serviços de análise de espectroscopia de biomassa de alta qualidade!

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